东京、大阪、京都相继发生杀人事件5名死者皆是被头戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬间杀害警方介入调查发现死者都是出没于3地专门偷窃有名的佛像及美术品的偷盗集团“源氏萤”成员该集团共有成员8名以义经的家臣名字互相称呼且都持有一本《义经记》被害5人手中的《义经记》均被拿走　　这日京都古寺山能寺收到奇怪书信说若能解开信中所附的画谜便能找到8年前被窃的如来佛像柯南、小兰随毛利小五郎来到该寺均对画谜一筹莫展5名被杀者之一曾对与新一不相上下的大阪高中生服部平次照料有加服部也来到京都对案件秘密展开调查并借机找寻自己的初恋情人柯南与服部相遇联手调查时发现有人想置服部于死地紧接“源氏萤”另一成员被害而这一切似乎又都与画谜有关